MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187078	TCG	2	6	61	66	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187078	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187078	CTT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187078	TTGT	2	8	252	259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187078	TTG	2	6	309	314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187078	CTG	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187078	T	6	6	448	453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187078	GCC	2	6	520	525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187078	TGA	2	6	550	555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187078	TTC	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187078	CCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NT_187078	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187078	ACCC	2	8	694	701	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NT_187078	TTGCT	2	10	729	738	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NT_187078	GCC	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187078	AG	3	6	867	872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187078	TA	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187078	AT	4	8	923	930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187078	T	6	6	1019	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187078	T	6	6	1042	1047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187078	TAA	2	6	1052	1057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187078	TGT	2	6	1076	1081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187078	AT	3	6	1124	1129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187078	AG	3	6	7179	7184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187078	ACC	2	6	7202	7207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NT_187078	GTG	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187078	GAAGC	2	10	9500	9509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NT_187078	GC	3	6	9526	9531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187078	GC	3	6	9542	9547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NT_187078	A	8	8	11708	11715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187078	AGC	2	6	11720	11725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187078	TTG	2	6	11740	11745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187078	GTCCC	2	10	11833	11842	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NT_187078	ATC	2	6	12777	12782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187078	TGT	2	6	12814	12819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187078	TTG	2	6	12877	12882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187078	TGC	2	6	12892	12897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187078	AAT	2	6	12959	12964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187078	TGT	2	6	12981	12986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187078	TGG	2	6	13065	13070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187078	GGC	2	6	13136	13141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187078	CGT	2	6	15620	15625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187078	GTTA	2	8	15638	15645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187078	GCC	2	6	15756	15761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_187078	ATT	2	6	17349	17354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187078	AG	3	6	17402	17407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187078	ATT	2	6	17475	17480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187078	TGAC	2	8	18995	19002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187078	A	6	6	19019	19024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187078	ATGA	2	8	19054	19061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187078	GGC	2	6	20257	20262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187078	CTT	2	6	20456	20461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187078	CTGG	2	8	20489	20496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187078	CAA	2	6	20563	20568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187078	ATT	2	6	20569	20574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187078	TGG	2	6	20611	20616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187078	ACG	2	6	20619	20624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187078	CAT	2	6	20644	20649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187078	T	6	6	20691	20696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187078	ATT	2	6	20829	20834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187078	TTA	2	6	20837	20842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187078	A	7	7	20870	20876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187078	CGT	2	6	22596	22601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187078	A	6	6	22623	22628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187078	TTG	2	6	22692	22697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187078	TGA	2	6	22781	22786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187078	TGT	2	6	22810	22815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187078	TCA	2	6	22843	22848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187078	CAG	2	6	23494	23499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187078	CCG	2	6	23541	23546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NT_187078	AAT	2	6	23638	23643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187078	GGCGG	2	10	26084	26093	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
73	NT_187078	ACA	2	6	26096	26101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187078	AAT	2	6	26913	26918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187078	T	6	6	26990	26995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187078	TGG	2	6	27032	27037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187078	A	6	6	27070	27075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187078	AATT	2	8	27098	27105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187078	CA	3	6	27109	27114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NT_187078	AGA	2	6	27121	27126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187078	GCA	2	6	27170	27175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187078	A	6	6	27180	27185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187078	AAG	2	6	27194	27199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187078	CGC	2	6	29258	29263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NT_187078	T	7	7	29264	29270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187078	GTT	2	6	29365	29370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187078	ATT	2	6	31243	31248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187078	TTTC	2	8	31275	31282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NT_187078	CAG	2	6	31303	31308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187078	ATT	2	6	31351	31356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187078	GTA	2	6	31415	31420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187078	TTTTTA	2	12	31442	31453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187078	T	6	6	31454	31459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187078	GCA	2	6	31478	31483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187078	CCAC	2	8	33311	33318	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NT_187078	ATAA	2	8	37288	37295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187078	GCG	2	6	37296	37301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187078	T	6	6	38282	38287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187078	GGA	2	6	38319	38324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187078	A	6	6	38328	38333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187078	TC	3	6	38935	38940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NT_187078	TAA	2	6	38949	38954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187078	ATT	2	6	39044	39049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187078	GCG	2	6	39072	39077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187078	TGG	3	9	39666	39674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187078	GGAT	2	8	40123	40130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187078	GC	3	6	40132	40137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NT_187078	CAT	2	6	40138	40143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187078	CG	4	8	40172	40179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NT_187078	T	7	7	40993	40999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187078	TAT	2	6	41018	41023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187078	T	7	7	41071	41077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187078	TAT	2	6	43978	43983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187078	GC	3	6	44031	44036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NT_187078	TTC	2	6	47612	47617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187078	A	6	6	47621	47626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187078	A	7	7	47646	47652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187078	TAA	2	6	47679	47684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187078	TAC	2	6	47732	47737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187078	TCT	2	6	47787	47792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187078	GCTG	2	8	47810	47817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NT_187078	CAA	2	6	48113	48118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187078	A	6	6	48117	48122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187078	AAT	2	6	48136	48141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187078	T	6	6	48206	48211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187078	ATA	2	6	48228	48233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187078	CGC	2	6	48235	48240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NT_187078	ATT	2	6	48248	48253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187078	AAAT	2	8	48265	48272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187078	AAT	2	6	48299	48304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187078	T	6	6	56143	56148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187078	GGCG	2	8	56173	56180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NT_187078	A	7	7	56187	56193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187078	ATT	2	6	56214	56219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187078	T	6	6	56246	56251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187078	CTG	2	6	56280	56285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187078	AGT	2	6	56314	56319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187078	G	6	6	56425	56430	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187078	GCC	2	6	56669	56674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NT_187078	T	7	7	56685	56691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187078	T	6	6	59823	59828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187078	CAAA	2	8	59927	59934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NT_187078	CGA	2	6	59942	59947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187078	TAA	2	6	60776	60781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187078	CGA	2	6	63095	63100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187078	TAT	2	6	63108	63113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187078	GCT	2	6	63120	63125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NT_187078	GTTCT	2	10	63138	63147	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NT_187078	TA	3	6	63180	63185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.